Донская духовная семинария реализует «Образовательные программы, направленные на подготовку священнослужителей и религиозного персонала религиозных организаций» (уровень бакалавриата).
Подготовка учащихся по образовательным программам уровня бакалавриата осуществляется в соответствии с разработанными Учебным комитетом Русской Православной Церкви документами, касающимися введения единого учебного плана в духовных образовательных учреждениях Русской Православной Церкви.
Разработка образовательных программ, направленных на подготовку священнослужителей и религиозного персонала религиозных организаций, проводится в соответствии с существующей в Русской Православной Церкви традицией духовного образования, получившей отражение в «Концепции высшего духовного образования Русской Православной Церкви», «Церковном образовательном стандарте высшего духовного образования специалиста в области православного богословия», «Концепции дальнейшего реформирования системы духовного образования Русской Православной Церкви».
Федеральные государственные стандарты высшего образования в учреждении не реализуются.
Единый учебный план в духовных образовательных учреждениях Русской Православной Церкви
Концепция высшего духовного образования Русской Православной Церкви
Концепция дальнейшего реформирования системы духовного образования Русской Православной Церкви